يتألف مجلس النقابة من النقيب ونائب النقيب ورئيس هيئة المكاتب والشركات الهندسية وعدد من الأعضاء يمثلون الشعب الست المختلفة، ويرشحون أنفسهم للمجلس وذلك حسب أحكام القانون والأنظمة الصادرة بموجبه.
يعمل قانون النقابة وأنظمتها المرجعيـة على تحديد الأهـداف والغايـات ليستند عليها مجلس النقابة في أداء وتنفيذ السياسات العامة بالإضافة إلى الاسترشاد بقرارات الهيئات العامة للنقابة وتوجهاتها (الهيئـة العامة، الهيئة المركزيـة، الهيئـات العامـة للشـعب الهندسـية، الهيئـة العامـة للمكاتـب والشـركات الهندسـية، والهيئات العامة للفروع)، وترد الأهداف بصورة عامة على النحو التالي:
يمارس المجلس عمله وفق الصلاحيات الممنوحة له في قانون النقابة وأنظمتها، حيث تنص المادة رقم(41) من القانون على ما يلي:
قبول المهندسين الأردنيين وتسجيلهم ومراقبة أداء القسم القانوني.
قبول المهندسين العرب والأجانب وتنظيم ممارسة العمل الهندسي لهم.
فتح سجلات لفروع الهندسة المختلفة وإضافة فروع أخرى.
إدارة ممارسة المهنة للمكاتب الاستشارية الأردنية وغير الأردنية ومراقبة أدائها.
تسجيل شركات المقاولات الهندسية الأردنية وغير الأردنية.
الإشراف على إعداد الحساب الختامي للسنة المالية المنتهية وإعداد مشروع الموازنة للسنة المقبلة لعرضها على الهيئة المركزية والهيئة العامة.
الإعداد لانتخابات الهيئات والمجالس النقابية على جميع مستويات النقابة.
تعيين الأمين العام للنقابة.
تعيين رؤساء اللجان النقابية.
تنفيذ القرارات الصادرة من النقابة وتوقيع العقود والتقاضي باسم النقابة واتخاذ صفة المدعي أو المشتكي في كل قضية تتعلق بأفعال تمس كرامة النقابة أو كرامة أحد أعضائها (كل هذا من خلال تمثيل النقيب لمجلس النقابة).
عقد اجتماع لمناقشة إدارة النقابة بواقع اجتماعين في الشهر على الأقل.
حلقة الوصل ما بين مجلس النقابة وجميع هيئات النقابة
حلقة الوصل ما بين مجلس النقابة والموظفين.
حضور اجتماعات المجلس وتدوين محاضر اجتماعات ويشارك في مناقشاته.
تدوين سجل وقائع جلسات اجتماع المجلس بصفته مجلساً تأديبياً.
تنظيم الأمور الإدارية والمالية للنقابة.
مسؤولاً عن وقائع جلسات الهيئة العامة والهيئة المركزية ويدون خلاصة المناقشات التي تدور في اجتماعات الهيئة العامة والهيئة المركزية العادية أو الاستثنائية مع القرارات المتخذة.
تمثيل النقابة في اللجان النقابية ومجمع النقابات واتحاد المهندسين العرب والهيئات المحلية المختلفة.